依照相关规划，医院信息化已经成为公立医院改革的重要抓手，并将在调节我国医疗资源分布发展不平衡，改善基层医疗机构综合能力和基层医生学术水平，提升医院服务质量和服务能力，以及改变公立医院管理模式等重要环节中发挥作用。
尽管近年来医院信息化在快速发展，但其仍存在区域和各层级医院之间发展不平衡的问题，在未来的发展中，需要改善信息系统的兼容性，体现规划的顶层设计、理性进行投资发展等方面。
全面发展兼顾平衡
国家《卫生事业“十二五”规划》明确强调，要加强医院信息化建设，建立医院诊疗行为管理和医务人员绩效考核信息系统，规范医疗服务行为，提高资源使用效率，尤其是推进基层医疗卫生信息化建设，建设三级医院与县级医院远程医疗系统。
这意味着以信息化为基础的国家医疗资源调配和公立医院效率改革，成为我国医疗卫生发展的重要工作内容。
近年来，医院信息化在我国取得了快速发展，门急诊划价收费、门急诊药房管理、药库管理；住院病人费用、床位管理;住院药房管理等系统是应用普及最广泛的内容，其中以收费和住院病人管理最为核心。
管理信息系统发展初期的动力，主要是医院为对接医保系统处理医保报销而被动信息化。但近年来，临床信息化获得了快速发展，HIS、PACS、LIS、EMR、图像处理和诊断等软件的应用，对医疗诊断水平的提高发挥重要作用，健康档案、远程医疗、移动医疗新概念已经成为今后明确发展的领域。
对此，有医院管理学者认为，医院信息化和医疗信息化如果能够较好地配合应用，将对当前我国医疗资源分布不平衡、基层医生学术能力和一、二级医疗机构综合能力的提升有很好的调节作用，也会对现有医疗模式产生很大的冲击，将推动医院临床发生重大变革。但是由于牵涉资金投入、软件技术开发以及牵涉领域较多等因素，目前基本处于探索阶段。
整体来看，目前我国医院信息化的发展也存在区域发展不平衡的特点，大医院信息化水平远远高于基层医院。全国近2万所县域医疗机构信息化发展也参差不齐，多数县域医疗机构甚至停留在医保支付管理系统使用阶段，一、二级医院由于受资金和人才等因素的制约，信息化的整体水平偏弱。
而在大医院，信息化部门始终很少真正被纳入医院管理核心团队范围，主要仍作为配合职能，不能对医院运营决策产生足够的影响。
基于上述各方面的综合影响，目前国家正在重新进行的医院等级评审中，对医院信息化内容的相关标准也提出了10条内容，涉及医院信息化管理组织、计划、制度标准，软硬件，对系统网络的管理维护，对人员的管理维护，对信息化项目的管理控制，与相关部门的互联互通，应急管理等多方面。可见，信息化建设在医院未来的发展中将担当更加重要的角色。
五大关键点
经过多年的推广和发展，部分大型综合医院在医院信息化建设方面已经取得了丰富的经验，北京大学人民医院院长王杉根据自身的经验提出了五大建议：
一是要谨防出现信息孤岛。据不完全统计，目前服务于医院信息化建设的提供商不少于600家，每家提供商所用的编码都有所不同，不仅导致医院与医院之间的信息不能相互共享，就连医院内部的信息化也不能互通互联。例如，门诊病人记录和急诊病人记录不能汇入一个系统内，门诊病人记录和住院病人记录不能互联互调等。
二是统筹规划要体现顶层设计。医院信息化建设的最终目的不是为了满足某家医院的自身发展，而是为了分析病种，减少医疗开支，这就要求在推进信息化建设的过程中，必须考虑全国的医疗服务信息的录入，如果不能从全局去考虑，医院信息化之路将越走越难。
三是以需求为导向，以需要为目的。很多地区为了提高医院信息化的普及率，盲目地增加信息化建设投入，购买了很多设备和系统，但医务人员的使用率很低。
四是专业的事情要由专业队伍来做。医院的信息关乎于患者的隐私，也记录着患者就诊的全过程。如果这些信息被泄露，或者被销毁，无论对医院，还是对患者，甚至对整个社会，都会造成不良影响。所以医院在选择信息软件提供商时，一定不能因为价格低就购买，要考虑提供商的资历、诚信等。
五是做好项目管理和质量考核。信息化的使用要建立考核机制，并将这种考核添加到系统中。这样一来，各个科室应用得好与不好，都能一目了然，这种考核机制能较好地促进医院信息化发展。