鸿翔一心堂自2009年开始兴建的呈贡基地包含了现代化物流中心的建设。呈贡基地物流中心投资1.6亿元，目前已投入使用。新的物流中心仓储面积超过3万平方米，使用了高位货架、大型叉车、自动化传输系统、电子分拣扫描系统等大量的现代物流设备，并顺利实现了SAP信息系统、WMS系统(仓库管理系统)、WCS系统(物流仓库控制系统)、MFC系统(物流输送线控制系统)及130台RF终端(无线射频终端)的无缝对接。该物流中心的建设还充分考虑了未来业务逐步发展的情况，无论是系统开发还是硬件搭配预留充足的拓展接口，以适应未来可能因业务拓展而新增的物流需求。该物流中心的建成能够支撑鸿翔一心堂未来三年在云南省内的药店发展及西南地区各子公司的部分商品集采供应功能。
现代化物流作为一种先进的组织方式和管理技术，被公认为是企业的一个重要利润源泉。 “物尽其用，货畅其流，掌握物流即掌握了市场”，随着鸿翔一心堂的不断深入发展，为了进一步加强物流配送能力和完善物流信息系统。鸿翔一心堂引入并运行SAPWMS(warehousemanagementsystem)仓库管理系统。2008-2011年鸿翔一心堂对该系统进行不断优化配置，并且增加了WCS系统(物流仓库控制系统)、MFC系统(物流输送线控制系统)，形成了完整成熟的物流信息系统。该套系统在物流中心的运用，一方面有效保证落实国家有关医药物流的管理和GSP控制，同时实现了进货管理、库存管理、订单管理、拣选作业管理、复核管理、集货集运管理、配送出库管理、商品养护管理、逆向物流管理、商品基本信息管理、在途管理等管理功能的高度集成；另一方面在该系统平台上有效集成了现阶段所需要的物流设备，如高位货架、大型叉车、自动化传输系统、电子分拣扫描系统、RF移动终端(无线射频终端)、提升机、中央空调、自动温控设备、电动搬运车、扫描平台、打印机、托盘、周转箱、冷藏设备、GPS(全球定位系统)等物流设备。通过网络化和数字化方式，形成了完整的物流作业管理系统。
通过该物流基地的建设，鸿翔一心堂形成了完整成熟的医药零售物流拓展模式，在需要的情况下、可以迅速通过复制形成跨区域、跨省级范围的物流网络，为鸿翔一心堂发展提供有力的保障。