2011年11月26日，水利部南京水利水文自动化研究所迁建30周年纪念大会暨学术报告会在南京召开，水利部胡四一副部长出席会议并讲话。
胡四一副部长代表水利部向南京水利水文自动化研究所迁建30周年表示热烈祝贺，向全所干部职工和离退休老同志致以崇高敬意和衷心问候。
胡四一指出，南京水利水文自动化研究所作为我国专业从事水利水文自动化及水利信息化研究的水利科研机构，走过了一段令人难忘的创业求索之路。30年来南京水利水文自动化研究所立足水利水文自动化事业，面向国家水利水电和国民经济建设发展需求，为我国的水文水资源管理、防汛抗旱减灾和水利信息化建设提供了有力的科技支撑，为国家水利水电事业的发展做出了重要贡献。2009年，水利部党组决定将南京水利水文自动化研究所划归南京水利科学研究院管理，更好地保障了研究所各项事业的健康发展。在南京水科院和部有关单位的大力支持和帮助下，南京水利水文自动化研究所坚持改革创新，积极调整业务重点方向，紧紧地抓住国家水资源信息系统、 国家防汛抗旱指挥系统二期等重点工程建设的有利时机，牵头承担了一批水利信息化研发与建设项目， 取得了积极进展，呈现出喜人的发展势头，令人鼓舞。
胡四一要求，面对新的发展机遇，南京水利水文自动化研究所要立足当前、着眼长远，抓住机遇，趁势而上，努力实现研究所良性运行和稳定发展。一要深化科技体制改革，营造良好的科研生产环境。要根据单位管理运行特点和需求，建立灵活高效的人事、劳动、财务制度，制定有利于促进科技创新的激励机制。对主要从事关键技术研究开发的科研人员要加大项目和经费的支持力度，使他们专心研发，多出成果，出好成果。对主要从事产品开发推广的科研人员要支持他们积极开拓市场，争取良好经济效益。院所领导要高度重视科研体制改革，积极争取国家和部里相关部门的指导和支持，努力克服研究所改革所遇到的困难，着力化解因科研体制改革配套政策长期不到位所积累的矛盾，尽力消除影响单位长远发展的障碍，为研究所长远稳定发展创造更好的体制条件。二要突出学科专业特色，服务水利现代化建设。要紧密围绕水利现代化建设的科技需求，突出水利水文自动化和水利信息化等专业特色，充分发挥研究所在水文监测、水情测报、水资源监控、工程安全监测、仪器质检技术等方面的技术优势，积极拓展水生态与水环境监测等新兴技术领域，进一步加强关键技术研究开发，加强仪器设备的推广、转化和应用，加快应用高新技术对水利传统行业进行技术改造和升级，为推进水利信息化、实现水利现代化贡献力量。三要进一步开拓市场，加强科技成果的推广和转化。要大力加强市场开拓能力，在市场竞争中谋生存求发展，要通过市场纽带，完善科技价值链，实现水利科技创新要素和其他社会生产要素有机结合，要不断研制出具有核心竞争力的新技术、新产品，对有市场前景的重要科研成果进行工程化研究和系统集成，大力加强科技成果的推广转化，实现技术创新和技术转移。四要培养造就高素质科研人才，加强院所文化建设。要营造优秀科技人才成长的良好氛围，最大限度的激发科研人员创新活力，要通过科技项目和工程建设项目的支持，加强技术带头人的选拔培养，鼓励青年科技人才承担重任。要加强科技人才的交流与合作，为优秀研发人才的脱颖而出创造环境。要继续保持和发扬研究所30年优良传统，加强院所文化建设，倡导创新求真，严谨务实的科学作风。
胡四一强调，水利部将一如既往的关心和支持南京水利水文自动化研究所的改革和发展，水利部相关司局以及南京水科院等单位要按照部里的统一部署和要求，在科技体制改革、科研能力建设、科技人才培养、科研项目安排及科技成果推广应用等方面给予重点支持和特别帮扶，共同促进研究所的科技创新和市场发展 。
纪念大会后，南京水利水文自动化所举办了学术报告会。