吉林省在建设现代中药及生物制药基地的过程中，将重点实施以下三大工程：
科技产业化项目示范工程。从现代中药及生物制药整个产业链出发，通过科技创新、技术整合和专业化分工，使以人参为代表的吉林省30余种原产地药材资源，通过深细加工不断增值；重点建设30个上规模的与工业企业对接的中药材规范化生产基地，5个中药饮片、配方颗粒加工基地；通过采用高新技术等措施，提高产品质量和现有中成药品种产业规模和水平；加速开发100种具有自主知识产权的现代中药、生物药及动物疫苗，尽快实现产业化。通过以上项目的实施，力争在2005年前使吉林医药工业总产值在现有基础上增加100亿元。
标准化建设示范工程。大力推行和实施医药行业的管理规范，规范新药研究、开发、生产和流通的过程，不断提升医药行业的标准化水平，加速国际化进程；加强中药质量控制技术的研究，保证中药产品安全有效、质量可控。
发展平台构建工程。其核心任务是优化产业发展的环境条件，重点是贯彻“三条主线”并进的思路：一是要构建政策环境平台、创新机制，创造一个有利于产业持续快速发展的良好环境；二是要构建现代中药及生物制药创新平台，围绕现代中药及生物制药公共研发平台建设，从几个关键环节入手提高吉林医药产业的创新能力；三是要构建组织协调平 台，进一步形成协调、高效、合力推进现代中药及生物制药基地建设的促进机制和工作体系。