在企业安装完氨氮在线自动监测仪且调试完成，并试用3个月后，企业向监测站提交委托申请，由监测站对氨氮在线自动监测仪进行监测验收。验收分质控样考核和实际水样比对试验两部分。
1.质控样品考核
采用国家认可的质控样，分别用两种浓度的质控样进行考核，一种接近实际废水浓度的样品，另一种超过相应排放标准浓度的样品，每种样品至少测定2 次，质控样测定的相对误差不超过标准值的±10%。
2.实际水样对比试验
采集实际废水样品，以水污染源在线监测仪器与国标方法进行实际水样比对试验，比对试验过程中保证水污染源在线监测仪器与国家标准方法测量结果组成一个数据对，至少获得6组测定数据，计算实际水样比对试验相对误差。对实验数据进行分析，根据HJ/T354-2007《水污染源在线监测系统验收技术规范》中水污染源在线监测仪器实际水样比对试验验收指标，80%以上氨氮分析仪仪器与手工测量值的相对误差应不超过±15%。
数据合格达标后，将监测数据及报告报当地环保部门备案，完成仪器的最终验收流程。