太阳能跟踪器能增加太阳能的接收，提高太阳光电的日输出功率和年输出功率，但当光伏组件或者光伏阵列中部分光伏电池受到间歇性遮挡时太阳能跟踪器能增加太阳能的接收，提高太阳光电的日输出功率和年输出功率，但当光伏组件或者光伏阵列中部分光伏电池受到间歇性遮挡时,输出伏安特性曲线呈现阶梯状，同时导致光伏阵列发电效率下降，系统发电量降低。
太阳能发电系统中，由于受电站土地使用面积限制，在电池组件安装支架之间允许预留的间隙条件下，在整个跟踪器过程中既要使太阳能板尽可能多的获得太阳光辐射能，又不能产生可能遮挡其他支架电池组件的阴影，跟踪器的阴影规避就是通过计算算法而形成的一套综合控制技术。
跟踪系统软件控制系统的阴影规避(图一)：
图一
★ 在T2-T3时间段从水平位置向东运动，进行阴影规避。
★ 在T3-T4时间段由东向西进行太阳跟踪运动。
★ 在T4-T5时间段由西向东，进行阴影规避。
★ 在T6时间点开始夜返，跟踪系统自动校准水平位置等待次日跟踪。
其中T2，T3及T4，T5是随日期的变化而变化，因此跟踪系统软件算法都会计算出当天的日出开始阴影规避时间T2和日出停止阴影规避时间T3，日落开始阴影规避时间T4和日落停止阴影规避时间T5。