研究所分类改革是中国科学院新时期全面深化改革的着力点和突破口,是中科院落实国家创新驱动发展战略、深化科技体制改革的一项重大战略举措。建设创新研究院是研究所分类改革的重要组成部分。
面向国家重大需求，组建若干科研任务与国家战略紧密结合、创新链与产业链有机衔接的创新研究院。坚持需求牵引和目标导向，选择若干战略必争领域和经济社会发展的重大需求，围绕产业链部署创新链，整合相关科研机构或科技资源，加强政产学研结合，提升顶层设计、协同攻关和系统集成能力，在牵头承担重大科技任务、突破关键共性核心技术、提供系统解决方案、解决重大科技问题上，做出关键性、引领性、系统性重大创新贡献。
根据《中国科学院“率先行动”计划组织实施方案》，2016年至2020年加强对第一批创新研究院正式运行后的过程管理和动态调整，推进重大成果产出。同时，围绕国家重大需求，不断凝炼重大科技问题，加强顶层设计，启动对第二批和第三批拟组建的创新研究院进行遴选、筹建工作。2020年前，选择国家急需和具备条件的重点领域，组建5至10个创新研究院；2030年前，再组建10至20个创新研究院。
中国科学院创新研究院（截止2019年2月，共有22家）
