未来5年，中国医疗信息化市场将出现如下发展趋势：
1、更多厂商加入到医疗业IT市场的竞争行列。纵观中国医疗信息化市场，从1993年起步至今，经历了三个发展阶段。第一阶段是大批做HIS的独立软件开发商(ISV)蜂拥出现；第二阶段是在价格战和不成熟的市场中，大批ISV倒掉；第三阶段则是国外公司介入。
未来中国医疗行业IT市场的快速增长，将受到更多厂商的关注。国际厂商中，除了英特尔把数字医疗单拿出来，作为与数字企业、移动市场并列的行业市场外，其他如IBM、Oracle、思科等都成立了专业的医疗行业部门。
而国内也有一些厂商看到了这个巨大的市场，正在介入，比如方正收购在医疗行业方案提供方面排列五大的ISV众邦。最值得关注的是国外公司的进入，它们无疑会使医疗信息化市场的竞争态势变得更如火如荼。
2、IT应用范围逐渐拓展，更多新兴应用进入眼帘。HIS一统天下的格局终将被打破，也正在被打破。继PACS(医疗影像信息系统)快速发展后，USIS(超声信息系统)、PIS(病理信息系统)、CMS(成本核算系统)、PEIS(体检信息系统)等也在发展，未来在电子病历、社区医疗以及更大范围的健康管理方面，还会催生更多的应用。
在应用上，仍将继续一个三步曲的进程。第一步，计费系统和临床系统；第二步，电子病历、结构化系统，更利于查询；第三步，工作流引擎、主件开发、SOA架构，更灵活，可以再造流程。
3、医疗IT产品与服务一体化同时得到人们的关注。在很多医疗行业的ISV看来，整合产品与服务，是解决原有市场利润率低的最好方式，也比较符合中国人的习惯。尽管医疗信息化相关服务还不是企业利润的主要来源，但越来越多的ISV开始靠服务，把市场做精做深。
4、竞争压力将促使医疗行业信息化产品与服务提供商企业之间整合。国内早期现身的ISV企业，生存下来的大都通过引入战略投资等方式，壮大规模，取得更多的生存与发展机会。这些成长起来的ISV下一步必将通过收购的方式，整合区域的小型ISV，获得更多客户资源，完善产品线，扩大战场，以应对国内外厂商的竞争。
5、整合产业链推进整合应用将成为未来发展主流。对于大部分主力ISV来说，技术越来越不能成为其发展的门槛，而整合应用将成为未来竞争的重点。通过与先进厂商的合作，在其平台上进行开发，将有利于国内厂商站到全球医疗信息化技术应用的前沿。整合产业链、整合医疗IT资源，将成为医疗信息化应用的主流。
6、随着市场的逐渐成熟，用户需求更加趋于理性。如果将医疗行业用户的IT采购划分为冲动型、印象型、理性化三种，那么经过几年的应用与发展，相关的流程与应用将成为用户关注的核心。而由于用户对业务流程与应用的考虑越来越多，用户的需求将更加趋于理性化。
7、医疗信息化外包，跨企业整合IT资源。从国外先进的发展经验来看，医疗IT系统外包已经得到一定程度的应用，而国内这一市场也进入预热期。医疗IT外包，某种程度上可能推动IT资源更快地整合，推进IT应用。比如，为了实施远程医疗系统，政府、医院、研究机构、电信基础设备运营商、大型专业IT外包服务商、医疗业ISV等，有可能整合为一张网，共同推进医疗卫生事业的发展。
8、公共卫生领域信息化将在全国快速发展。2003年以后，公共卫生领域信息化的发展步伐加快；2005年以后，公共卫生领域信息化需求有加速释放的迹象；预计从2007年开始的未来5年中，中国不同地区公共卫生领域信息化的发展将进一步加速。
9、区域医疗信息化整合需求将到更多的释放。2006年底，国家科技部公布“区域协同医疗服务示范工程”重大项目课题承担单位名单时，已明确提出要汇聚多方力量，以“资源共享、长效服务、低成本、低风险”的建设理念，构建涵盖医疗、教育、行业管理、疾病报告及公众健康服务的信息服务平台。
在医疗行业改革进程中，如何充分整合医疗资源，更好地实现患者在社区医疗机构与大型医院之间的转诊成为一个关键，而区域医疗信息化整合解决方案将成为支撑其发展的一个关键。