8月26日，南水北调济平干渠平阴段水量增大。从8月18日开始南水北调济平干渠参与东平湖分洪，由于8月16至17日，山东省中部地区出现强降雨过程，东平湖防洪压力骤然增加。省防总为减轻东平湖防汛压力，决定通过济平干渠向小清河放水。济平干渠自东平湖出湖闸至济南市西部的小清河源头睦里庄闸，全长90公里，是南水北调东线首批于2002年12月开工建设的单项工程，2005年12月按期完成主体工程建设并一次试通水成功。该工程建成后，不仅可先期将东平湖水调往济南市玉清湖水库，以缓解济南市供水紧张局面，而且在这次东平湖泄洪方面发挥重要的作用。 中新社发 张庆民 摄
“南水北调工程的调水水质正面临着被污染的威胁，必须引起足够警惕。”
26日，全国人大环境与资源保护委员会主任委员毛如柏向大会作全国人大环境与资源保护委员会关于跟踪检查淮河、辽河流域水污染防治情况报告时说，检查发现，南水北调工程的调水水质正面临着被污染的威胁，必须引起足够警惕。
检查组在江苏省徐州市看到，徐州市三分之一的污水经奎河污水处理厂达标处理后，排入发源于本地的奎河，但徐州市铜山县还有3家造纸企业向奎河排污，致使奎河由江苏进入安徽的省界断面水质污染严重。
按照治污规划的要求，徐州市另外三分之二的污水需要经过污水处理厂集中处理后排入不牢河和房亭河，通过截污工程导入同为淮河支流的新沂河入海。但是，徐州的截污导流工程至今没有完成规划批复，工程还没有实施。据反映，扬州、淮安和宿迁的截污导流工程规划同样因意见不一致至今未批，新的方案也未确定，导致大量污水进入南水北调输水干线。
山东省济宁市南四湖是南水北调东线的重要调蓄湖泊，检查发现其水污染治理同样也存在滞后问题。