智能住宅小区在建设初期，房地产开发商往往注重智能化系统功能配置的水平与相应的投资，十分重视这些智能化系统功能对于楼盘销售的直接影响，而对住宅小区智能化系统运行与维护的费用以及相应的管理模式很少考虑。但是一旦智能住宅小区建成并投入使用，各种问题就会随之显现。
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首先是物业管理人员的能力。如小区内设有网站或信息中心，则需要计算机硬件软件专业的技术人员，管理安防系统需要了解应用电视与控制的专业技术，管理操作建筑设备监控系统、一卡通、物业管理系统等需要控制与应用电子技术专业的技术人员。如果物业管理人员专业能力不足，维持智能化系统的运行则是困难的，一些住宅小区将智能化系统弃之不用的部分原因就在于此。
其次是智能化系统的运行与维护费用。智能住宅小区由于设置了众多的智能化系统，设备日常运行需要一定的费用，如安保监视电视系统需要不断更换录像带与打印纸，一卡通系统需补充IC卡片与打印纸等等。这些配件与易耗品虽然单价不高，但一年下来，其费用还是相当可观的。
另外，各类智能化系统的设备中还有大量的易损与易老化的器件，尤其是以低价竞标配置的系统在运行中往往频发故障，必须更换部分设备。
目前，多数智能住宅小区的各类系统尚在免费维护期内，日后若需付费维修保养，那对于物业管理公司来说又将会是一笔很大的开支。这一费用目前尚未能充分列入物业管理成本，如届时不能支付的话，故障系统几个月得不到修复，很可能以后就无法启用了。